MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salinibacter ruber M8 plasmid pSR56

Total Repeats: 953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014028	CGAGA	2	10	111	120	40 %	0 %	40 %	20 %	294502070
2	NC_014028	GAG	2	6	127	132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294502070
3	NC_014028	GCC	2	6	163	168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502070
4	NC_014028	GC	3	6	192	197	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
5	NC_014028	GAG	2	6	247	252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294502070
6	NC_014028	GCT	2	6	280	285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502070
7	NC_014028	GC	4	8	310	317	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
8	NC_014028	ACCG	2	8	364	371	25 %	0 %	25 %	50 %	294502070
9	NC_014028	GCT	2	6	400	405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502070
10	NC_014028	GC	4	8	430	437	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
11	NC_014028	ACCG	2	8	484	491	25 %	0 %	25 %	50 %	294502070
12	NC_014028	GCT	2	6	520	525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502070
13	NC_014028	GC	3	6	552	557	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
14	NC_014028	GAG	2	6	607	612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294502070
15	NC_014028	GCT	2	6	640	645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502070
16	NC_014028	GC	3	6	672	677	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
17	NC_014028	ACC	2	6	721	726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502070
18	NC_014028	CT	3	6	736	741	0 %	50 %	0 %	50 %	294502070
19	NC_014028	GCC	2	6	763	768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502070
20	NC_014028	GC	3	6	792	797	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
21	NC_014028	GAG	2	6	847	852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294502070
22	NC_014028	GCC	2	6	883	888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502070
23	NC_014028	GAC	2	6	901	906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502070
24	NC_014028	GC	3	6	912	917	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
25	NC_014028	GTC	2	6	934	939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502070
26	NC_014028	GAG	2	6	967	972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294502070
27	NC_014028	GCC	2	6	1003	1008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502070
28	NC_014028	CGA	2	6	1017	1022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502070
29	NC_014028	CG	3	6	1031	1036	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
30	NC_014028	ACCG	2	8	1084	1091	25 %	0 %	25 %	50 %	294502070
31	NC_014028	GCC	2	6	1123	1128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502070
32	NC_014028	GAC	2	6	1141	1146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502070
33	NC_014028	GC	3	6	1152	1157	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
34	NC_014028	ACCG	2	8	1204	1211	25 %	0 %	25 %	50 %	294502070
35	NC_014028	GCT	2	6	1240	1245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502070
36	NC_014028	GC	4	8	1270	1277	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
37	NC_014028	GTC	2	6	1294	1299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502070
38	NC_014028	GAG	2	6	1327	1332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294502070
39	NC_014028	GCC	2	6	1363	1368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502070
40	NC_014028	CGA	2	6	1377	1382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502070
41	NC_014028	CG	3	6	1391	1396	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
42	NC_014028	ACCG	2	8	1444	1451	25 %	0 %	25 %	50 %	294502070
43	NC_014028	GCC	2	6	1483	1488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502070
44	NC_014028	CG	3	6	1511	1516	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
45	NC_014028	ACCG	2	8	1564	1571	25 %	0 %	25 %	50 %	294502070
46	NC_014028	GCT	2	6	1600	1605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502070
47	NC_014028	GC	4	8	1630	1637	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
48	NC_014028	GTC	2	6	1654	1659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502070
49	NC_014028	GAG	2	6	1687	1692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294502070
50	NC_014028	GCC	2	6	1723	1728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502070
51	NC_014028	CGA	2	6	1737	1742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502070
52	NC_014028	CG	3	6	1751	1756	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
53	NC_014028	ACCG	2	8	1804	1811	25 %	0 %	25 %	50 %	294502070
54	NC_014028	GCC	2	6	1843	1848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502070
55	NC_014028	GAC	2	6	1861	1866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502070
56	NC_014028	GC	3	6	1872	1877	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
57	NC_014028	ACCG	2	8	1924	1931	25 %	0 %	25 %	50 %	294502070
58	NC_014028	GCT	2	6	1960	1965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502070
59	NC_014028	GC	4	8	1990	1997	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
60	NC_014028	GTC	2	6	2014	2019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502070
61	NC_014028	GAG	2	6	2047	2052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294502070
62	NC_014028	GCC	2	6	2083	2088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502070
63	NC_014028	CGA	2	6	2097	2102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502070
64	NC_014028	CG	3	6	2111	2116	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
65	NC_014028	ACCG	2	8	2164	2171	25 %	0 %	25 %	50 %	294502070
66	NC_014028	CG	3	6	2231	2236	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
67	NC_014028	ACCG	2	8	2284	2291	25 %	0 %	25 %	50 %	294502070
68	NC_014028	GCC	2	6	2323	2328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502070
69	NC_014028	CGA	2	6	2337	2342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502070
70	NC_014028	CG	3	6	2351	2356	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
71	NC_014028	GC	3	6	2443	2448	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
72	NC_014028	GGAT	2	8	2452	2459	25 %	25 %	50 %	0 %	294502070
73	NC_014028	TCCTC	2	10	2465	2474	0 %	40 %	0 %	60 %	294502070
74	NC_014028	GA	4	8	2478	2485	50 %	0 %	50 %	0 %	294502070
75	NC_014028	TGG	2	6	2489	2494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502070
76	NC_014028	CCA	2	6	2564	2569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502070
77	NC_014028	GTG	3	9	2665	2673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502070
78	NC_014028	GCTG	2	8	3040	3047	0 %	25 %	50 %	25 %	294502071
79	NC_014028	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502071
80	NC_014028	AAAGG	2	10	3084	3093	60 %	0 %	40 %	0 %	294502071
81	NC_014028	GGA	2	6	3114	3119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294502071
82	NC_014028	CGCT	2	8	3169	3176	0 %	25 %	25 %	50 %	294502071
83	NC_014028	CGG	2	6	3375	3380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502071
84	NC_014028	GAT	2	6	3426	3431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502071
85	NC_014028	GA	3	6	3432	3437	50 %	0 %	50 %	0 %	294502071
86	NC_014028	GAGAA	2	10	3520	3529	60 %	0 %	40 %	0 %	294502071
87	NC_014028	TATCG	2	10	4477	4486	20 %	40 %	20 %	20 %	294502072
88	NC_014028	GGGAT	2	10	4490	4499	20 %	20 %	60 %	0 %	294502072
89	NC_014028	TCC	2	6	4553	4558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502072
90	NC_014028	GAA	2	6	4646	4651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502072
91	NC_014028	AAG	2	6	4660	4665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502072
92	NC_014028	ACC	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502072
93	NC_014028	TGA	2	6	4791	4796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502072
94	NC_014028	CAG	2	6	4926	4931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502072
95	NC_014028	GGA	2	6	4937	4942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294502072
96	NC_014028	TCTAC	2	10	5126	5135	20 %	40 %	0 %	40 %	294502073
97	NC_014028	CAGG	2	8	5141	5148	25 %	0 %	50 %	25 %	294502073
98	NC_014028	ATC	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502073
99	NC_014028	CGGA	2	8	5207	5214	25 %	0 %	50 %	25 %	294502073
100	NC_014028	TCT	2	6	5226	5231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502073
101	NC_014028	ACC	2	6	5262	5267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502073
102	NC_014028	GTA	2	6	5285	5290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502073
103	NC_014028	TAC	2	6	5460	5465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502074
104	NC_014028	CGA	2	6	5518	5523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502074
105	NC_014028	GAGAA	2	10	5529	5538	60 %	0 %	40 %	0 %	294502074
106	NC_014028	AAG	2	6	5570	5575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502074
107	NC_014028	CGC	2	6	5579	5584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502074
108	NC_014028	GC	3	6	5608	5613	0 %	0 %	50 %	50 %	294502074
109	NC_014028	GGT	2	6	5629	5634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502074
110	NC_014028	C	6	6	5694	5699	0 %	0 %	0 %	100 %	294502074
111	NC_014028	GAT	2	6	5746	5751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502074
112	NC_014028	ACG	2	6	5931	5936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502075
113	NC_014028	TCC	2	6	5939	5944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502075
114	NC_014028	GAG	2	6	5970	5975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294502075
115	NC_014028	TC	3	6	6008	6013	0 %	50 %	0 %	50 %	294502075
116	NC_014028	CCT	2	6	6024	6029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502075
117	NC_014028	CGC	2	6	6066	6071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502075
118	NC_014028	CTT	2	6	6205	6210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502075
119	NC_014028	GT	3	6	6260	6265	0 %	50 %	50 %	0 %	294502075
120	NC_014028	GGT	2	6	6400	6405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502075
121	NC_014028	ACC	2	6	6425	6430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502075
122	NC_014028	TCC	2	6	6443	6448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502075
123	NC_014028	CGG	2	6	6476	6481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502075
124	NC_014028	TGG	2	6	6548	6553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502075
125	NC_014028	TCCC	2	8	6598	6605	0 %	25 %	0 %	75 %	294502075
126	NC_014028	TTG	2	6	6652	6657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502075
127	NC_014028	TCG	2	6	6665	6670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502075
128	NC_014028	GGTC	2	8	6680	6687	0 %	25 %	50 %	25 %	294502075
129	NC_014028	GCG	2	6	6701	6706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502075
130	NC_014028	GTC	2	6	6712	6717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502075
131	NC_014028	CTC	2	6	6766	6771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502075
132	NC_014028	CCCT	2	8	6804	6811	0 %	25 %	0 %	75 %	294502075
133	NC_014028	CCG	2	6	6812	6817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502075
134	NC_014028	TCC	2	6	6878	6883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502075
135	NC_014028	TCT	2	6	6938	6943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502075
136	NC_014028	CTCA	2	8	6979	6986	25 %	25 %	0 %	50 %	294502075
137	NC_014028	CATC	2	8	6999	7006	25 %	25 %	0 %	50 %	294502075
138	NC_014028	CCT	2	6	7029	7034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502075
139	NC_014028	GA	3	6	7051	7056	50 %	0 %	50 %	0 %	294502075
140	NC_014028	GCC	2	6	7126	7131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502075
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142	NC_014028	GCC	2	6	7189	7194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502075
143	NC_014028	GCCC	2	8	7388	7395	0 %	0 %	25 %	75 %	294502076
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151	NC_014028	TTG	2	6	7798	7803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502077
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159	NC_014028	GAG	2	6	8278	8283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294502078
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164	NC_014028	TAC	2	6	8671	8676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502078
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172	NC_014028	CTTCGG	2	12	9343	9354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502079
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266	NC_014028	AAG	2	6	14362	14367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502081
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268	NC_014028	GAG	2	6	14511	14516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294502081
269	NC_014028	TC	3	6	14587	14592	0 %	50 %	0 %	50 %	294502082
270	NC_014028	GGA	2	6	14598	14603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294502082
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385	NC_014028	CAG	2	6	21809	21814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502087
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388	NC_014028	TCC	2	6	21975	21980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502087
389	NC_014028	GCTC	2	8	21984	21991	0 %	25 %	25 %	50 %	294502087
390	NC_014028	GCTT	2	8	22015	22022	0 %	50 %	25 %	25 %	294502087
391	NC_014028	GGC	2	6	22051	22056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502087
392	NC_014028	TCT	2	6	22087	22092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502087
393	NC_014028	CGA	2	6	22204	22209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502087
394	NC_014028	TCG	2	6	22326	22331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502087
395	NC_014028	TTC	2	6	22383	22388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502087
396	NC_014028	GAG	2	6	22401	22406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294502087
397	NC_014028	CGC	2	6	22502	22507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502087
398	NC_014028	TCC	2	6	22608	22613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502087
399	NC_014028	CGT	2	6	22639	22644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502087
400	NC_014028	ATC	2	6	22647	22652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502087
401	NC_014028	CTT	2	6	22723	22728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502087
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413	NC_014028	TCGCC	2	10	23206	23215	0 %	20 %	20 %	60 %	294502087
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417	NC_014028	CGT	2	6	23395	23400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502087
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425	NC_014028	ACGT	2	8	23706	23713	25 %	25 %	25 %	25 %	294502087
426	NC_014028	CTC	3	9	23729	23737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502087
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